Hallo Holger,
wie Tilmann würde ich dir empfehlen die Tour direkt vor Ort zu buchen. Eine Agentur kann man nicht wirklich empfehlen da diese ständig ihren Service und Namen ändern. Vor Ort bei anderen Touris Erkundigungen einziehen.
Von San Pedro (Chile), Uyuni und Tupiza (Boliven) lassen sich leicht Jeep-Touren organisieren. Achten solltest du darauf, dass die Anbieter ein gewisses MAß an Sicherheit und Umweltverträglichkeit haben. Die meisten Touren starten in Uyuni und dann wird es eine Rallye mit ca. 40 Jeeps die versuchen zu erst an einer "Sehenswürdigkeit" zu sein. Diese Sehenswürdigkeit darfst du dann mit 240 anderen Touris - die auch die Einsamkeit der Salar erleben wollen - genießen. Besser ist wohl von Tupiza aus zu starten, da hier noch weniger Touris anzutreffen sind. Kosten für 4 Tage ca. 120 Euro. Die ganze Tour ist auch von San Pedro möglich aber kostenintensiver.
Solltest du die Atacam von San Pedro aus erkunden wollen, bedenke bitte, dass dieses kleine Dorf nur gebaut wurde um Touris zu beherbergen. Wir haben auf unserer ganzen Reise keinen Ort in SudAmerika mit so vielen Touris erlebt (Okay wir waren auch nicht in Machu Picchu

).
Eine Bericht über unsere Tour durch die Salar findest du hier:
http://2feelfree.de/das-bein-noch-ein-stuck-hoher/
Ein kleiner Hinweis noch: Das Alitiplano liegt auf über 4000 Meter und du solltest schon gut akklimatisiert sein bevor du in den Jeep steigst, sonnst kann das schnell eine Tour der Leiden werden.
Falls du noch mehr Infos benötigst nur zu!
Grüße
Christian